一九四八年八月初，白崇禧在南京軍事會議中曾反對守點守線，像長春、太原、濟南那些孤立的戰略據點，應當及早撤退，而集中全力來鞏固華北及中原地區，但蔣介石不予採納。
到同年九月，共軍不失時機地進攻山東省城濟南。二十五日，泉城失陷，省政府主席王耀武被俘。至此，人民解放軍已自信有攻擊的能力，就放手發動決定國共命運的三大戰役之一——“遼瀋戰役”，而以打下錦州爲其第一目標。
十月十五日，錦州失陷，這等於關上了東北的大門，共軍對關內衛立煌集團，那就無異甕中捉鱉。何應欽看到東北會戰已近尾聲，保衛南京這個政治中心問題，已經迫在眉睫了。於是召集參謀總長顧祝同，參謀次長劉斐、蕭毅肅，第三廳廳長郭汝瑰舉行會議，研究中原作戰的計劃，經過反覆討論，最後決定讓白崇禧統一指揮中原大軍（即指揮華中、徐州兩個“剿總”的全部軍力），以適應徐蚌會戰的迫切需要。這本來是白崇禧在是年六月初提出的意見，但卻被蔣介石一口否決了。現在急時抱佛腳，何應欽又認爲它是軍事上的應變大計了。
何應欽在徵得白崇禧的同意後，即於十月二十三日派郭汝瑰專機向蔣介石建議，蔣介石自東北會戰開始，即偕杜聿明、周至柔、郭懺、羅澤闓等穿梭飛行於北平、瀋陽之間，親自指揮作戰，郭汝瑰抵北平之日，即長春失守之時。
郭汝瑰對蔣介石說：“顧總長交代，說白健生統一指揮是暫時的，會戰結束後，兩個‘剿總’仍須分區負責。”蔣介石聽了，卻對郭汝瑰說：“就叫他統一指揮下去好了。”二十四日，郭汝瑰回到南京，何應欽即以“酉敬陽揮電”下達這一命令。
十月三十日，蔣介石聆悉廖耀湘兵團在西進途中進入預先佈置的口袋，全部被殲，新一軍、新六軍的美式軍械裝備完全落入解放軍手中。蔣介石聞訊驚心喪氣，倉皇飛返南京。是日下午四時，白崇禧應召從漢口飛寧，五時，參加國防部長召開的軍事會議，聽取羅澤闓關於東北會戰從錦州失守到大虎山廖耀湘全軍覆滅的報告。會後，白崇禧到傅厚崗副總統官邸對李宗仁說：“如果蔣介石聽他及早收縮東北戰線的建議，就不致有今日的潰敗。”言下不勝惋惜。
十月三十一日上午，國防部繼續開會，討論中原作戰問題，白崇禧聽了郭汝瑰報告徐州“剿總”兵力部署情況，即翻然變計，推翻前議，不肯統一指揮中原大軍了。
原來杜聿明早日到徐州“剿總”當劉峙的副總司令後，爲了遵照蔣介石的指示，支援濟南作戰，把華東地區編成三個兵團，以第二兵團邱清泉部集結商邱，黃伯韜第七兵團集結新安，李彌第十三兵團集結宿縣固鎮。後來，李彌兵團又北上徐州。白崇禧認爲，徐州“剿總”如此部署兵力，像一字形地把部隊攤開在隴海線上。而津浦線南面縱深配備不夠，一旦會戰展開，想把主力南移是不易的。現在時間短促，他想重新部署，已經來不及了。如果白崇禧將來不能撤出徐州的主力保衛淮南，蔣介石一定把責任推在他的身上。他害怕蔣氏造成圈套使他上當，於是振振有詞地對何應欽說：“徐州‘剿總’如此部署兵力，要想把它改變已經時不我與了。”後來證之事實，果然如此。
白崇禧拒絕統一指揮中原大軍，蔣介石誤會李宗仁從中破壞，於是下令給毛人鳳，制訂一套暗殺李宗仁的計劃，而由沈醉來執行。後來這一計劃所以沒有付諸實施，是因爲蔣介石支持紐約州長杜威競選總統，而十一月七日，美國大選的結果，還是杜魯門勝利，繼續坐鎮白宮。這一來，蔣氏驚慌失措。十一月二十八日，派宋美齡赴美辦理善後，亦無裨益於大局，不得不做下野的準備。在這種情況下，他不需要對李宗仁下手了。
白崇禧拒不受命指揮徐蚌會戰以後，蔣介石指示國防部擬訂一個“集中兵力於蚌埠附近，以擊破共軍攻勢爲目的”的作戰計劃。何應欽仍採納白崇禧的原議，提出了“守江必守淮”的主張，決定：徐州“剿總”除以一至兩個軍堅守徐州外，其餘隴海線上的部隊全部集結于徐州、蚌埠間兩側地區，作攻勢防禦，尋機會與共軍決戰。但蔣介石對這一方案，並不立刻實施，因而誤時失事。
直到十一月四日，蔣介石纔派顧祝同到徐州。五日，顧祝同在徐州召開高級將領會議，對上述作戰計劃作了部署，命令剛剛發出，十一月六日凌晨，人民解放軍便發動徐蚌戰役，徐州“剿總”措手不及，使原定計劃成爲畫餅。
徐蚌戰役一開始，共軍因得三綏區馮治安、張克俠（1900—1984，1929年秘密加入中國，從此，在國民黨軍隊臥底20載，直到1950年才公開了他的身份。1955年，被授予“一級解放勳章”。後又當選爲第四屆全國人大代表、全國政協第五屆常委。）所部三個半師的陣前起義，以主力迅速南下佔領徐州以東碾莊至曹八集一帶地區，這樣就把原駐新安的黃伯韜兵團隔絕包圍於碾莊，整個地把它消滅了。
十一月七日，蔣介石在黃埔路官邸召集軍事會議，參加的有顧祝同、杜聿明、郭汝瑰、侯騰（1907—1963，國民黨陸軍中將。任過國民黨政府國防部第二廳廳長。1949年去臺灣，任臺國防部副部長、臺國防大學校長等職，1963年在美國病逝。）。會上，已接到黃伯韜兵團在碾莊被圍的消息，決定以李彌兵團守徐州，令邱清泉、孫元良兩兵團回徐州東進，以解碾莊黃伯韜兵團之圍。這證明統帥部對於前線情況並不確切瞭解。
十一月十一日晚，杜聿明帶一批幕僚人員從南京飛抵徐州，指揮徐淮會戰，他當時得到的情況如下：邱清泉第二兵團被劉伯承、鄧小平的中原大軍牽制，無法東調；孫元良的第十六兵團十一日晚上纔到達徐州以南三堡附近；黃伯韜第七兵團在碾莊被圍處境困難；黃維第十二兵團從華中地區東調，已到阜陽附近。
黃維兵團怎樣從華中調來的呢？當蔣介石十一月初在徐蚌與共軍進行戰略決戰時，曾電華中“剿總”白崇禧着張軫（1894—1981，保定軍校、日本士官學校畢業，國民革命軍陸軍中將。1942年率軍入緬甸作戰。1949年率部金口起義。1950年任解放軍湖北軍區副司令員。）兵團全部東調，支援徐州，張軫問白崇禧：“徐蚌會戰有無把握？”白說：“徐州致命的弱點是在隴海線上平均分散部署兵力，而在徐州以南又無縱深配備，估計要把主力撤到徐蚌之間進行攻勢防禦很不容易。”張軫聞白崇禧這麼一說，就把任務（白崇禧建議改調黃維兵團馳援徐州）推掉了。
杜聿明到徐州以後，於十三日開始以空軍配合步、炮兵和戰車向東面展開攻擊。打了一個星期，毫無進展。到了十一月二十二日，黃伯韜兵團全部被殲了。此時劉峙、杜聿明如果當機立斷，即將主力南移，還有可能成功，但杜聿明還想死守徐州，以後又到南京開會，錯過時機，噬臍無及。
黃維兵團的十二萬人馬浩浩蕩蕩從湖北東開，十一月十九日到皖境雙堆集就陷入共軍重圍。是次黃維去打宿縣，是受命於蔣介石的。正因如此，才使他遭此厄運的。假如徐州“剿總”在徐州南面配備着足夠兵力。就不必有此一舉。黃維兵團被圍以後，杜聿明所統率的徐州“剿總”主力因行動遲緩，到十二月三日，也在永城附近的陳官莊地區陷入共軍重重包圍之中。
此時，蔣介石又想從華中調兵，來解救杜聿明之危。白崇禧看到蔣介石如此指揮作戰，無論從華中調去多少兵力，要想挽回徐蚌會戰敗局，已經完全不可能了。於是他對蔣介石從華中調取援兵之舉，一再暗加掣肘。
十一月二十七日，白崇禧接到蔣介石的“手啓”電，要白氏轉知所屬第十四兵團司令宋希濂偕新任的第十三綏靖司令王凌雲（1899—？，1943年任國民黨政府第二軍軍長兼滇西警備司令，進入緬甸抗戰。1947年任十三綏靖區司令兼行政長官，在南陽成立情報機構和聯合法庭，殘殺人。1950年初被解放軍俘虜。1959年獲特赦。文革初期，離家出走，下落不明。）到南京一行。宋希濂率部此時駐鄂西一帶，奉命後即偕王凌雲於三十日到漢口，並隨即去三元里總部謁白崇禧，報告鄂西方面的全部情況。
他們辭出時，白崇禧要宋希濂單獨東下，對他介紹了當時軍事形勢，白崇禧說：“遼瀋會戰失敗，東北幾十萬大軍全被消滅了，而且這些部隊大部分都是美械裝備。得了這樣一大批精良的武器，他們很快就可以組建很多的生力軍，進而揮戈入關，奪取平津，形勢是嚴重的。”
白崇禧把話題立即轉到徐州方面，他說：“徐蚌方面，黃伯韜兵團已在碾莊地區全被消滅了；黃維兵團在東進途中也在雙堆集附近地區被圍；現在總統電召你們到南京去，一定是要調你這個兵團東下增援。這樣，武漢地區只剩下一個張淦兵團和魯道源、張軫、陳明仁等幾個軍而已。這些部隊，除廣西的第七軍、第四十六軍、第四十八軍較有戰鬥力外，其餘都是新編成的，未經嚴格訓練，是沒有多大戰鬥力的。你的部隊再調走，武漢地區就顯得更空虛了。共軍在中原和華東方面，劉伯承、陳毅兩個野戰軍合起來兵力在一百萬以上，就是把你的部隊調去，也不能解徐州之圍，而且時間恐怕也來不及了。”
“總司令以爲應怎樣辦？”宋希濂問道。
白崇禧站起來，走到牆上掛的一幅大地圖面前，以很興奮而又帶有幾分自信的語氣說：“我們如果保有武漢，必要時就可以和進行和談，即萬一武漢不保，也可退守湖南和兩廣，擁有西南半壁，維持一個時期。”宋希濂聽了他的話，沉吟了一下，以嚴肅的態度對白崇禧說：“東北已經淪亡，平津亦岌岌可危，如徐蚌一帶的主力再被共軍消滅，恐怕要促成一個南北朝的局面已經不可能了。目前仍應以救大局爲重。”
白崇禧聽了宋希濂的話，狠狠地看了宋一眼，說：“這樣吧，你這一次到南京去，最重要的是瞭解情況。如果看形勢已無法補救，最好向總統和顧總長要求免調。”
十二月一日上午十二時宋希濂偕王凌雲飛抵南京，即去黃埔路官邸謁蔣介石。蔣氏說：“現在徐蚌地區進行決戰，希望你們的部隊儘快東開，加入戰場後，先以全力解黃維兵團之危，然後再會同杜聿明的部隊擊破共軍，穩定戰局。”
辭出時，宋希濂讓王凌雲先走，他對俞濟時說：“有話要同校長單獨談。”黃埔學生對蔣介石都稱“校長”以示親密，蔣氏引宋希濂到他的辦公室，坐下後後者就把白崇禧在漢口對他所說的話一一彙報，蔣介石聚精會神地傾聽着，然後對宋氏說：“好，我知道了，你答覆他的話，說得很得體。”
宋希濂回到任所以後，先將劉秉義第二十八軍從鄂西調到漢口，準備東開。最初，白崇禧表示不讓調走，經顧祝同親自打電話疏通，白氏才知道該軍和顧祝同有着歷史關係，只好勉強同意調走。跟着宋部第二十軍楊幹才也開到了漢口，白崇禧發現這個軍的官兵都是四川人，他們都不願東調，就示意軍長楊幹才電顧祝同要求免調。白崇禧並命令漢口運輸司令部，非有他的手令，第二十軍不準裝運。後來，顧祝同派第三廳廳長許朗軒飛到漢口見白崇禧，並經許的老師、華中“剿總”參謀長徐祖詒居中斡旋，白氏才答應讓第二十軍調走。
宋部第二軍陳克非部於十二月九、十兩日從沙市先後到達漢口，白崇禧派總部警衛團將輪船看守起來，不準裝運。顧祝同電話疏解，毫無效果。蔣介石急壞了，便親自打電話同白崇禧通話。唯白氏無論如何不肯答應。蔣介石一時火起，罵白氏不服從命令。白崇禧說：“合理的命令我服從，不合理的命令我不能服從。”蔣氏最後氣得把電話機使勁地往桌上一摜，用他的寧波土話，罵了一聲“娘希匹”。
蔣、白關係至此到了決裂階段。