6月25日，在“大和”號上進行了一次濟州島作戰的圖上演習。演習中卻最生動不過地說明了日軍狂妄自大和輕率愚蠢達到了何等地步！根據演習的裁判計算，中國方面投中了九枚炸彈，擊沉日軍兩艘戰列艦。這一客觀結論，卻被先改爲命中三彈，擊沉擊傷戰列艦各一艘，最後竟索性改爲一艘也沒有損失。完全可以這麼說，此時此刻，日軍根本沒有想到過失敗。高木武雄海軍中將還向參加演習的指揮官和參謀人員作了詳細報告。
當晚山本海軍大將和參加圖上演習的參戰部隊指揮官及參謀人員在“大和”號聚餐，喝着天皇所賜的米酒，爲祝願即將到來的作戰獲得成功而乾杯。至此，日軍戰前準備一切就緒。
1903年6月27日，瀨戶內海西部著名軍港柱島錨地，朝霞映照着規模龐大的日本艦隊。柱島位於廣島以南，錨地周圍是許多丘陵起伏的小島，小島上從岸邊直到山頂都是農田，每座山頂都部署着嚴密僞裝的高射炮羣，錨地之大足以容納整個日本海軍，而且遠離商船航道，優越的天然條件簡直是爲聯合艦隊度身定做的。開戰以來，第一艦隊和第一戰列艦戰隊就一直停泊在柱島，以等待傳統的海上決戰，以至於一直巡邏偵查在外的軍艦，以諷刺的口吻把它們稱爲“柱島艦隊”。
此時，這支龐大的艦隊正靜靜地等待着出擊，每艘軍艦都已完成了出海準備，加滿了燃油、彈藥和補給品，因此沉重的載重將水線壓得很低。整個錨地一片寂靜，除了軍艦上的旗幟在風中獵獵作響，但是人們卻分明感覺到激動的情緒瀰漫着整個艦隊，這一天正是日本海軍節，聯合艦隊士氣高昂，官兵們都確信，此次出海將爲日本海軍增添新的光榮！
8時整，“大和”號戰列艦升起了起航信號，第十驅逐艦戰隊，第八巡洋艦戰隊，第三戰列艦戰隊第二小隊等戰隊依次拔錨，開赴戰場。
當艦隊駛出錨地時，晚出發的其他部隊官兵列隊歡呼，揮動帽子爲他們送行，整個氣氛是喜氣洋洋的，許多來自日本各縣的年輕女孩子們，也都站在岸邊爲出征的官兵吶喊鼓勁，昨晚她們爲了大日本海軍的勝利剛剛向這些士兵們獻出了自己的初夜，每個人都深信這將是一次輝煌勝利。
艦隊在中午前後通過了豐後水道，傍晚時已深入太平洋，以環形巡航隊形向東南挺進。出航後不久，“大和”號飛行長，空中總指揮淵田美津雄海軍中佐就因急性闌尾炎，被送進了艦上的醫務室。幾天後第一航空艦隊作戰參謀源田實海軍中佐，也因重感冒引發肺炎而住進醫務室，這兩位日本海軍最優秀的航空軍官因病缺陣，對於不熟悉航空業務的南雲來說，簡直就是失去了左膀右臂。而聯合艦隊總司令山本此時也正遭受着胃病的煎熬，日本海軍三位精通航空業務的人傑，在這大戰前夕不約而同病倒，似乎預示着這次海空決戰流年不利！
接下來幾天其他部隊也按計劃出發了。細萱海軍中將的北方編隊，於6月28日從大湊起程；同天晚上，運送濟州島登陸部隊的運輸船在田中賴三海軍少將指揮下，從長崎軍港出發，爲了欺騙中國潛艇，運輸船隊先向西航行繞到菲律賓海域北面，再轉向東北。幾乎同一時間慄田健男海軍少將的重巡洋艦支援部隊從關島出發，在運輸船隊西南約40海里並肩東進。近藤海軍中將指揮的登陸編隊和山本直接指揮的主力編隊，是最後出發的部隊，於6月29日清晨從柱島啓程。
面對咄咄*人的日本海軍，對劉步蟾來說此時的形勢極爲嚴峻，他馬上組織海軍部官員通過對日軍現狀的分析研究，判斷日軍如果發動攻勢的話，濟州島必將是首要目標，所以他放下手頭繁忙的工作，親自前往濟州島視察。他仔細檢查了島上的防禦工事，查看了通訊設施和線路，一旦戰鬥打響，將是最重要的通訊線路。
接着劉步蟾又與濟州島守備司令郭輝和地面部隊司令馬紹良進行了交談，郭輝提出了一連串物資需求，劉步蟾皺着眉問：“是否解決了這些東西，你就能守住濟州島？”
郭輝毫不猶豫地回答：“能！”
劉步蟾當即答應了郭輝的要求，並竭盡所能向濟州島增調物資和人員。至6月下旬時，濟州島的守備部隊增至3000人，飛機也從4架增至20架，其中包括水上飛機、戰鬥機、俯衝轟炸機、重型轟炸機。
在得到這一消息之後，山本五十六諷刺道，“這麼多飛機壓在小小的濟州島上，只怕濟州島要有沉沒的危險了！”
與此同時，中日之間的海軍情報大戰也已經率先展開了。
帝國海軍作戰部長陸忠麟希望情報部門密切關注日軍的戰略動向，北洋艦隊情報部門電訊監聽站，開展了極其艱鉅的密碼破譯工作。
這個站的站長就是戴笠。戴笠雖然年輕，卻被人稱爲“魔術大師”，曾留學日本，是一個地地道道的日本通，同時又是通信和情報分析的專家，憑藉着豐富經驗和嫺熟業務，領導對日軍通信密碼的破譯工作。
戴笠向陸忠麟做出保證，在對日作戰中，中國海軍艦隊永遠不會缺少情報。
此後，他和他的部下，數十名電臺監聽員、密碼破譯員、翻譯和情報分析員，在警衛森嚴的威海軍港第14海軍軍區司令部大樓的地下室裡夜以繼日地工作，他們的工作環境幾乎與世隔絕，每週工作時間高達八九十小時，日本海軍百分之90的電訊往來都被他們所截獲。
日本海軍此時使用的代號爲JN—25B密碼，該密碼系統主密碼是由4.5萬個五位數數碼組組成，爲增加安全保障，還配有五萬組五位數亂編數碼組，通信時發信方加入任意幾組亂碼數。其中一組告之收信方使用密碼本的頁數、段數，亂編數碼組經常變更，但是主密碼基本不變，這就大大便利了戴笠的破譯工作。
尤其是在今年5月，日本在與澳大利亞的一次海戰中，在菲律賓海域沉沒了一艘軍艦，中國隨即派出蛙人潛入海底，意外的打撈起了JN—25B密碼本，使戴笠的破譯工作獲得了飛躍性的進展，至此，中國已經能夠了解日本海軍大部分通信秘密。
更爲幸運的是，日軍原定於啓用新的JN—25C密碼，由於日軍在太平洋上的迅猛發展，佔領區面積十分廣闊，要將新密碼分送到分散在各地的部隊手中，需要不少時間，因此日軍將新密碼的啓用時間推遲，這就使得日軍在濟州島作戰準備期間的大量電信往來，都不得不使用舊密碼。
戴笠於6月20日截獲並基本破譯出聯合艦隊司令下發給各部隊的長篇電文，掌握了日軍的作戰計劃，只是由於日軍始終用AF作爲戰役目標的代號，還無法確定哪裡是日軍的進攻目標。但戴笠根據日本電報的命名習慣，堅定的認爲AF是濟州島。記憶力過人的戴笠還從浩如煙海的電文中找到前不久的一份日軍電報，電報是要求水上飛機從馬紹爾羣島起飛，中途在弗裡格特珊瑚礁從潛艇上接受燃料補給，再飛往鶴舞軍港，電文還提到要注意避開來自AF的空中偵察，從地圖上分析AF只能是濟州島！
“日本人的艦隊是不是全部出動了？濟州島能不能守住？我們有沒有相應的措施？本土艦隊最近的部隊在哪裡？”一個個問題如同連珠炮一樣砸在了林建章的頭上。
“全部都靜一靜！”林建章的聲音很大，而且猛力敲着桌子，看得出來他此時的心情很焦躁。他努力平靜了一下自己的心緒，這纔開口說到：“根據我們的情報表明，日本人出動了全部的主力艦隊，勢必要奪下濟州島，此外我們還發現原本在舞鶴港停泊的四艘最強的戰列艦大和號等也消失了。我們的海面偵察部隊正在竭力的搜索，可是還沒有發現對方。我認爲他們也許正在難免的某個地方等待迂迴過來。最有可能的是，在爪哇一線，因爲那裡有他們的基地支援。但是也不排除在菲律賓海域。”
林建章略微停頓了一下，接着說道：“至於艦隊的數量，由於日本人的動作比較突然，所以我們的艦隊並沒有完全準備完畢。北洋艦隊的主力就要到達濟州島了，但是南洋艦隊還在海路上奔波，所以我建議先等一等，等到我們的艦隊完全集中完畢之後，再對日本人發動攻勢。這樣，我們的損失會小很多。”
“不行！絕對不行！因爲這樣一來我們就沒有時間了。日本人已經控制了太平洋南部和東部海域，那裡已經變成了日本軍艦的遊獵區，我們必須趕在日本人抵達濟州島之前，利用我們壓倒性的優勢一舉消滅對方。首先我們必須奪取朝鮮南部沿海的制海權，特別是面向日本航線的制海權，這條航線對我們來說非常的重要，所以我要求你們乘着日本海軍立足未穩，尚未到達之前，分兵兩路，一路抵禦日本艦隊的進襲，另一路向日本西部海島發動攻擊，重創敵人的軍港。”海軍裝備部部長葉祖珪堅持着自己的意見。