果然如馬楠擔心的那樣，第二階段星主計劃實施後，史進緊接着向白雲間提出星主特權的議案。
小太陽是個理想主義者，自然是強烈反對這種分化階級的制度，他表示擴充星主名額是爲了提高全體拓荒者的生存條件，如今要給星主們賦予特權，完全違背了白雲間最初的意志。可事到如今，小太陽一步步掉入史進的算計之中，他再想回頭去找馬楠共同推翻議案，才發現他們兩人都成爲了權利真空的吉祥物，空有司令長和**的名頭，卻沒有任何實質權利。
史進是個聰明人，自然不會威逼小太陽認可星主特權，他說出了一番看似正當的理論，稱一切付出都需要等額的回報，星主們承擔了最重要的生產活動，所以需要給予等價的特權以求維穩。
在問題沒有顯現之前，這番理論不僅得到了星主們的支持，普通拓荒者也沒有明確反對。
就這樣，星主特權得以推行，可不久後就出現了階級分化的矛盾，星主們以極高的姿態成爲白雲間的‘神’，他們享受普通民衆擁戴的同時，所有的行爲無法得到有效約束，甚至因特權滋生出很多腐敗及黑惡勢力，千葉松子就是其中的代表之一，他憑藉爲星主們提供特殊服務，換取他們的特權勢力作爲庇護，使用水晶粉致使很多人上癮，從而控制他們繼續爲星主們的糜爛生活提供保障。逐漸形成了一種地下的黑惡勢力，讓普通民衆逐漸難以忍受。不過，星主特權是在他們的認可下施行的，在想反對爲時已晚。
馬楠眼見事態惡化，只能暗中聯絡明哥，讓他想辦法救出Rayen教授，儘早完成限制星源之力的研究，從而掌握約束星主行爲的能力。
明哥在白雲間很具威望，他同時又是小太陽的左右手，所以他想私自救出Rayen教授是件簡單的事，只是這之後該怎麼辦，纔是最令明哥頭疼的事。他先是以探望爲藉口見到Rayen教授，與他商量出逃後的計劃。他們擬定了一套逃跑路線，明哥在白雲間做掩護，馬楠則爲其提供科研相關的設施，儘早掌握約束星主行爲的能力，就可以不必再躲躲藏藏。
按照計劃，明哥到醫院請阿娜爾罕爲Rayen教授做全身檢查，假稱他患有心臟疾病，需要儘快到醫院進行手術摘除，更新替代爲克隆的心臟。白雲間的人自然不敢馬虎，畢竟Rayen教授是草薙星的科研權威，即便現在囚禁他，可未來的發展少不了他的科研成果，所以並沒有多想，立即主動派人將Rayen教授送到醫院。
阿娜爾罕曾是我五人突襲小組的成員，與馬楠和我的交情不錯，她又是個極富正義感的人，所以很願意配合馬楠，幫助Rayen教授擺脫白雲間的控制。她將教授安排在2樓單獨的病房裡，以準備手術爲由將看守支到門外，並說已經爲教授打了一針安睡的藥劑，使守衛們放鬆了警惕。
阿娜爾罕安排的單間窗口朝向背街，沒有人員在此處經過，所以她直接架起了一個摺梯通到窗口，讓Rayen教授可以安全地爬下來。隨後給教授換上的衣服，讓他去兩三寺找明哥匯合。教授走後，阿娜爾罕撤走摺梯回到病房，將牀單撕扯開綁成一長條從窗口順下去，僞裝成Rayen教授獨自逃離的假象。
等到守衛們發現時，Rayen教授已經在兩三寺裡與明哥見面，進行後續的部署。
白雲間得知Rayen教授逃脫，第一反應是去查看水晶骸骨。那時，它早已經被明哥轉移到自己的辦公室裡，任白雲間怎麼搜查，也沒找能到它的下落。
兩三寺的大佛背面被明哥掏出了一個能容人躺平的洞，Rayen教授就藏在裡面，每天由亦凡和尚照看。
一直過了將近三個月，白雲間始終無法找到教授和骸骨的下落，事情也就漸漸告一段落。
此事一出，倒讓史進得了便宜，因爲教授和骸骨丟失，意味着全民星主計劃無法實施，更加有利於穩固他主張的星主特權。後來他乾脆敷衍搜查，甚至停止調查，因爲教授流落在白雲間和部隊以外，就意味着必然生存不下去，只有兩條路可以選擇，一是回到白雲間，二是等待死亡。
白雲間嚴密監視着每一個人，只要有異常的動作，就會被仔細調查，所以明哥無法再去兩三寺與Rayen教授見面，馬楠更是全然不知道計劃進行到哪一個步驟，只能寄希望於白雲間儘早忘了這件事，等待調查鬆懈後，與明哥進行聯絡。
白雲間最終對外公佈了Rayen教授出逃的事件，說他偷走了水晶骸骨，導致無法執行全民星主計劃，民衆們極其憤慨，將Rayen教授當成了公敵。
史進這一招確實管用，既有效限制了星主計劃的實施，又讓逃脫的Rayen教授不敢輕舉妄動，可謂十分得意。
馬楠和明哥最初設想救走Rayen教授，進行限制星源之力的研究，可如今任何一絲小動作都可能招致白雲間的逮捕，所以只能靜靜地等待時機。
小太陽還被矇在鼓裡，他想要繼續推進搜尋水晶骸骨一事，除了史進等人不再支持他，連馬楠也是含糊着說讓他不要繼續調查。此時他孤立無援，除了將此事作罷沒有其他選擇。
又過了一段時間，白雲間新城的建設如火如荼，所有人的注意力都放在建設上，對教授和骸骨失蹤的事逐漸淡忘，主要是沒人再願意提及。
馬楠這時才主動聯繫明哥，想要儘快讓Rayen教授進行接下來的實驗，儘早掌握限制星源之力的方法。明哥和教授商議後，最終選定了二號礦下的水晶洞穴作爲實驗室。因爲那裡已經被白雲間搜查過無數次，不會再次引起搜查人員的注意，況且他們只會敷衍了事，到礦井外轉上一圈就回去較差，絕不會深入地下裂縫近千米處的一個小洞穴裡仔細搜查。而且那裡的水晶爲實驗提供了便利，能很好地進行接下來的研究。
於是馬楠自己先悄悄按照教授的要求往水晶洞穴運送設備，他擔心引起別人的注意，只在晚上進行運送，並且分了很多次才完成。
明哥藉口調換辦公室，將水晶骸骨分裝在幾個袋子和花盆裡，然後悄悄運出來送到二號礦下的水晶洞穴。
接下來Rayen教授的研究他們不再參與，只是由明哥定期送去一些生活所需。
Rayen教授爲了儘快達成限制星源之力的目的，用我的DNA克隆了一個新的身體，並將水晶骸骨作爲新身體的骨架，以“人”來限制星源之力是最簡單快捷的方式。選擇我，不光是因爲我已經犧牲，是很好的試驗素材，更是因爲他們信任我，讓我來承擔這個責任。
我終於知道爲什麼當初復活時沒人來看望我，甚至大家都宣稱不知道復活我一事，因爲明哥和馬楠不能當着小太陽的面說出實情，只能是故作驚訝，然後裝傻充愣，把一切都歸於在逃的Rayen教授身上。
後來馬楠讓我負責搜尋水晶骸骨一事，也是爲表現出他不知道水晶骸骨藏在哪。他不僅知道水晶骸骨在我身體裡，而且後續全民星主計劃也全在他的計劃之中，所以纔敢使用強權甚至冒着風險獨裁這一計劃的實施。
他看似是粗獷魯莽，實則是個極有能力的領導者。