木葉，白站在金宇家的廢墟前，想起了魔神的三個願望，唱起了這首歌曲《三個願望》。雖然這首歌曲與那位魔神沒有一點關係。晶臧道，“我們當年一起許下的三個願望，每一天都有感動值得收藏，每一夜天使陪我祈禱仰望，每滴淚都被你的魔法變陽光。現在還在起作用，雖然家園被毀了，但我們大家都平安無事，沒有什麼比這個更讓人高興的了。”白笑道，“是啊，我們要重新把家園建設起來，讓生活更美好。”
整個木葉沉浸在戰勝佩恩的喜悅中，鳴人受到英雄般的禮遇。遠方不遠之處，黑白雙絕從大樹中鑽出來。白絕道，“佩恩竟然會被人幹掉，這真是意想不到的事情。”黑絕道，“去將這件事告訴阿飛，快走！”黑白雙絕從大樹中消失，以蜉蝣之術遁地而走，遠行千里。
雷之國，胸器迷人的薩姆依，杞人憂天的奧摩伊，樂觀向上的卡茹依，兩女一男三人踏上前往火之國木葉村的征程。路上，奧摩伊開始了絮叨，“該怎麼辦呢？”卡茹依疑惑，“啊？纔剛剛離開村子，你這是怎麼了？已經累得走不動了嗎？”奧摩伊道，“不是啦，想起剛纔雷影大人……”雷影艾再三強調，不管用任何辦法都要救出奇拉比。奧摩伊道，“雷影大人的眼淚，就那樣流個不停。要是形成了池塘，形成了湖泊，在我們回來的時候，村裡已經像雨隱村一樣溼漉漉了。這該如何是好啊？”
卡茹依徹底服了，“怎麼可能會有這種事情呢？眼淚要形成湖泊，那得哭多久才行啊！”奧摩伊不服，“可是那是雷影大人啊！有那麼強實力的話，形成湖泊也只是家常便飯那麼簡單！不，不止是湖泊，也許會形成巨大的海洋！如果波濤滾滾的海浪將我們吞沒的話……到底該如何是好……”卡茹依終於受不了了，“啊，煩死人了！夠了，你的想法太累人了。”奧摩伊瞄了一眼薩姆依的胸部，“大胸薩姆依一直說胸部很重，肩膀很累，我能理解。但飛機場的卡茹依你說累的話……”
這句話戳到了卡茹依的痛處，她飛起一腳將奧摩伊踢飛，“無路賽！”奧摩伊跌倒在地，“好疼！”薩姆依無可奈何，只好上來勸解，“喂，你們兩個，任務纔剛剛開始啊！到木葉最快也要4-5天的時間。你們想一直保持這樣的狀態嗎？在中途不許停下休息的哦！快點出發了！”卡茹依和奧摩伊一起答應，三人加快速度，從樹上快速穿梭行進。
木葉，伊魯卡、雀、椿和另外一名中忍教師，身材較胖的船野大黑（46歲）的前輩，4人回到木葉學校的舊址，這裡已經是一片廢墟了。伊魯卡道，“真是慘不忍睹啊！”雀道，“看來很長一段時間要在野外教學了。”椿道，“我們分頭找一找，看看還有沒有能夠使用的教材。”雀道，“是啊，盡力做好我們現在力所能及的事情吧！”大黑道，“是啊，那麼各位就……散！”4個人分頭去尋找可以用的東西。
伊魯卡通過火影巖的舊址，“這裡也是一團糟啊！”來到學校的前面，伊魯卡驚奇地發現吊着鞦韆的那顆大樹竟然依然矗立，“真是個奇蹟啊！”
鳴人戰勝了佩恩拯救了整個木葉忍者村，此時的鳴人已經得到了全村人的認同，而年少時的鳴人卻總是以惡作劇來吸引村民的注意力。
伊魯卡站在學校前面倖存的大樹下，緬懷與鳴人相識時的時光，爲自己的學生感到驕傲，“鳴人，是你的話，真的能夠成爲火影也說不定。”兩個中忍喊道，“伊魯卡老師，請來這裡幫忙。”伊魯卡答應，“好的，我馬上過去。”
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隱蔽的住所，宇智波佐助睜開了眼睛，“水月去哪裡了？”香燐手裡拿着一個小本，“水月？誰知道呢！兩三天之前出去閒逛之後，就再也沒回來。我看他多半是回霧隱村了。最好他永遠也不要回來！”水月的聲音傳來，“我可是聽到了哦！”大門被一腳踢開，水月扛着斬首大刀興高采烈地跳進來。香燐疑惑，“斬首大刀……你怎麼還拿着那種東西呢？”水月道，“你們之前逃走時沒有帶上它，我去取回來可是費了一番功夫啊！”香燐道，“與八尾人柱力戰鬥之時，誰還有空去撿回那種累贅啊！”
重吾道，“把瀕死的你們給搬回來的，可是我哦！別起內訌了！”香燐譏諷，“真是小肚雞腸啊！”水月揮舞大刀，“算了，不管怎麼說，大刀還是回到了我的手中。果然沒了它，我就沒狀態啊！”佐助站起來，“這樣人就到齊了吧！我們休息了很長一陣子了，全員準備出發！”水月道，“你的傷沒事了嗎？”佐助點頭，“痊癒了，現在動身，前往木葉。”
曉組織，外道魔像之前，黑白雙絕報告了佩恩的整個戰鬥過程，“事情就是這樣，我們該怎麼辦？”阿飛道，“我沒想到長門竟然隱藏了這麼多絕招，那個輪迴眼的幻術大概是留着對付……更沒想到佩恩會被人幹掉啊！真是意料之外！”黑絕道，“小南已經不會回到這裡來了。”白絕道，“怎麼辦？缺席這麼多人。還需要一個能和外道魔像同步的角色啊！”阿飛想了想，“鬼鮫，你去尋找八尾人柱力。”鬼鮫問道，“你呢？”阿飛道，“我還有些其他的事要處理。”
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木葉，大和站在外圍區域，看着環形的深坑，“這是……居然會發生這種事情……”鹿久跳上來，“你來晚了啊！”大和吃驚，“難道說是鳴人他……”鹿久道，“不，是佩恩乾的。”大和道，“曉的首領佩恩嗎？”鹿久道，“但鳴人已經解決了問題，他打敗了佩恩。”大和道，“鳴人嗎？那九尾呢？”鹿久道，“他用自己的力量壓制住了。”大和長出了一口氣，“這樣啊！……什麼？鳴人靠自己的力量壓制了九尾……”
鹿久道，“沒時間這麼震驚了！接下來村子的重建可有得忙了。大和，我們需要你的力量。”大和道，“是！我們得先用土遁忍術，把村子的地基重新壓平，然後在……”一個面具暗部忍者突然瞬身出現，鹿久道，“怎麼了？”暗部忍者道，“召開緊急會議。作爲上忍班長的鹿久大人，請速往大名殿。”鹿久道，“這麼快啊！我知道了。”暗部忍者瞬身離去了。
大名殿，火之國大名搖着扇子坐在正中央。他的右手邊坐着火之國的官員，包括負責財政的管理者戴着眼鏡的談合。左手邊都是木葉的人，三代猿飛、兩位顧問長老、團藏、暗部班長和上忍班長奈良鹿久。猿飛道，“我們和同盟國將繼續展開對抗曉的措施。”爲首的眼鏡官員道，“村裡已經變成那樣，我們火之國自當爲村裡重建提供全力支援。”猿飛道謝，眼鏡官員道，“首先要籌劃預算……接下來是緩和其他國家的緊張關係……”
團藏突然道，“比起這些，有些事情要必須先做。選誰來做新任的火影。”鹿久暗道，“果然是來這招啊！”猿飛道，“五代火影綱手還健在，等她恢復就可以。”火之國大名贊成，“不錯啊！綱手姬可是衆望所歸啊！”小春憂心忡忡，“大名閣下，只是綱手一直處於昏睡狀態。現在村裡又是這種狀況，她又不知道何時能醒來。”門炎道，“我們擔心其他國家會趁着這個時機發動對火之國的戰爭。”小春道，“是啊，沒有火影，恐怕會影響村裡方針的及時決定。”
猿飛道，“那綱手昏迷期間，由我這個老朽來暫代火影之位如何？”大名覺得是個好辦法。團藏道，“木葉遭到毀滅性破壞，猿飛，你身爲三代火影，難道沒有責任嗎？木葉現在這個狀況，總要有人站出來承擔責任吧！不然的話，怎麼向村民們和忍者們交代？”猿飛嘆氣，“唉，木葉被毀，我應該承擔主要責任，是我沒有及時打敗佩恩。綱手爲了保護大家，查克拉消耗殆盡，已經盡了全力。”鹿久暗叫不好，“團藏早就料到三代目爲了維護綱手，肯定會站出來承擔所有的責任。這樣三代就沒辦法重新代理火影了。”
火之國大名拍了拍扇子，“我明白了。那三代目就不適合再次代理火影了。我想這次該輪到自來也了吧！我很欣賞他，尤其是他寫的小說……三代目，你也沒什麼意見吧！他也是你的弟子呢！”猿飛露出悲慼的容色，“可惜自來也已經不在了。”大名吃驚不小，“怎麼會呢？”猿飛把自來也戰死雨隱的情況講了一遍，“我們想過一陣子再通知大名閣下的，但是佩恩卻直接來襲木葉……”大名唏噓不已，“自來也竟然……那麼還有什麼其他的人選嗎？”團藏站起來，毛遂自薦，“既然如此，就讓我……”
鹿久急忙道，“我推薦旗木卡卡西！”團藏左眼裡都是殺氣，右眼依然蒙着眼罩。猿飛道，“我也贊成卡卡西來接任火影，他本來就是下一任火影的候選人。”大名道，“哦，我知道，是白牙的兒子嗎？嗯，倒也不錯，大家怎麼看？”猿飛極力推薦卡卡西，說了卡卡西很多英雄事蹟。
官員們也議論紛紛，“他確實是名聲、實力、品德兼備。”“但他會不會太年輕了點？”猿飛馬上道，“四代火影水門那時候不是更年輕嗎？而且砂隱的新任風影，還不滿18歲。相比之下，卡卡西已經成熟穩重很多了。這個危難時期，一個年輕朝氣蓬勃的火影會帶給大家新的希望。”
官員們紛紛點頭，爲首的眼鏡官員談合問道，“旗木卡卡西是誰的弟子啊？”猿飛道，“他是四代火影波風水門的弟子。”大名道，“這樣啊，四代火影好像是自來也的弟子，自來也又是三代火影的弟子。我看沒問題了，好，那麼就……”團藏出離憤怒了，“就是三代火影猿飛的教誨，才把村子逼到了如今這種等同於毀滅的地步。”大名大吃一驚，“啊？”猿飛站起來，“團藏！你不要太囂張了！”小春道，“團藏，大家都是同伴，不要這麼說。”
團藏生氣，“我難道說錯了嗎？差點毀了木葉的大蛇丸，就是猿飛你最得意的學生！將木葉摧毀的曉的首領，就是自來也的親傳弟子！同情他國之人，傳授他們忍術的結果就是這樣。”猿飛一時語塞，不管怎麼說長門確實是自來也的弟子，而大蛇丸這個逆徒就是猿飛親手教授出來的。
團藏道，“這一切都太過天真了！正是因爲這個代代相傳的天真，纔會導致同盟國砂隱的背叛，並縱容了大蛇丸對木葉的進攻。然後是曉的崛起，宇智波餘黨佐助成爲叛忍！他們活躍於暗地，蠢蠢欲動。”
猿飛、鹿久都陷入了沉默，團藏的指責雖然有些激烈，但他說的也都是實情。團藏大聲道，“值此危急存亡之秋，木葉需要的火影，是能夠處理糟糕的事態，並妥善善後，給忍者世界帶來變革，徹底完善忍者世界的定則。”猿飛並不認同團藏的話，但現在除了卡卡西，他實在找不出下一個候選人了，“鳴人的話太年輕了，又那麼衝動，就算推舉鳴人，也不會被通過。怎麼辦？”鹿久也叫苦，“完全沒想到團藏這次會這麼激烈。早知道如此，應該先跟三代目商量一下。”
團藏神情激動，他抓住了猿飛一系的弱點，猛烈抨擊，讓他們無法還擊，“衆望所歸，火影就是我！我纔是最合適擔任火影的人！”猿飛只好道，“團藏，你先別激動，火影人選事關重大，我們從長計議。”團藏怒道，“木葉都被毀了，還從長計議？難道還要等到風土雷水四大國再次圍攻我們時，大家再推舉火影嗎？”兩次忍界大戰的教訓，讓衆人刻骨銘心。官員甲道，“團藏說的有道理，可不能再讓歷史重演了。”官員乙道，“在這個緊要關頭，不能再猶豫了。哪怕是做出一個壞的決定，也比什麼都不做要好。”
官員丙道，“大名大人，這種時候，就交給志村團藏來處理如何？”大名有些意動，團藏的能力他還是多少知道的。鹿久急忙道，“這只是表面合理的單方面做法……”大名擺手，“不，我決定了！團藏，就任命你爲第六代火影！”猿飛和鹿久都大爲焦急，卻無法改變大名的決定。團藏大喜過望，他夢寐以求的願望，終於實現了，爲了這一天，不知道花了多少時間和心血，等待了多少的歲月，不擇手段做了多少血腥的事情，“但這一切都是值得的，我終於要成爲火影了！”
五代火影綱手經歷過一場大戰一直昏迷不醒，於是團藏提出需要更換一個火影，就在團藏自薦成爲下一任火影的時候，鹿久和猿飛舉薦卡卡西，儘管全場的呼聲偏向於卡卡西，但團藏卻不停的揪出卡卡西等人的短處不放，最終成爲第六代火影。