麻生太郎聽完孫志仁的一通辯解，紅着臉說道：“對不起啦，是我的口誤，是在不好意思，爲此我再一次向大清朝以及孫大人承認是我們日本國的錯誤。”
孫志仁看着麻生太郎說道：“今天皇上就近期我大清朝與貴國的談判給予恩准了，但是要求我看到日本國的真心誠意之後方能與貴國進行下一步的談判工作。”
孫志仁同時還進一步說道：“我大清朝皇上要求我禮部再一次舉辦報業記者參加的新聞吹風會。”
當然會議的主要內容就是涉及到我大清朝目前對朝鮮以及在朝鮮發動戰爭的日俄雙方的一些主張，希望日俄雙方在征戰中要遵循國際原則，不能傷害無辜平民，對此我大清朝是不會做事不管的。“
孫志仁講完這些話之後看着日本公使麻生太郎，看看麻生太郎有什麼反應，孫志仁只見麻生太郎臉上閃過一絲不快瞬間即逝了。
麻生太郎當人知道大清朝現在是漫天要價，不慌不忙，這現在忙慌的國家當是日俄兩國國家，他們都希望大清朝給他們一個保證，不再幹預朝鮮境內的一應事務……
麻生太郎見今天就是再在孫志仁的禮部衙門耗上一天，也不會得到自己想要的結果，於是只好站起來告辭道：“孫大人，我們現在告辭了，在此我再次向孫大人亮明我們日本國對大清朝的底線，希望大清朝能夠出兵幫助我國將俄國人從朝鮮趕出去。”
“當然最好是大清朝與我日本國結成政治同盟，那樣的話整個亞洲將是貴國與我國所主宰的了。”麻生太郎說完之後便起身向孫志仁拱手作別了。
孫志仁起身與麻生太郎作別，將麻生太郎送出禮部衙門之後，便回去張落安排明天的記者吹風會。
次日上午記者吹風會如期在禮部舉行了，這時孫志仁在幾天之內召開的第二次記者吹風會，在會上孫志仁再次就中日甲午海戰，對日本提出來措辭將爲嚴厲的抗議。
他說道：“抗議日本人一面打着要與大清進行談判的旗號與大清進行談判，但是其不守信用不講道義居然在與大清朝繼續談判的同時，又一次派出海軍企圖偷襲我大清剛剛組建的北洋水師。”
“所幸我大清朝北洋水師積極防範，在出港訓練的途中巧遇起日本海軍，並將日本海軍消滅在我大清黃海海大清朝的一則，纔將日本企圖偷襲我大清朝的計量給破滅了。”
孫志仁接着說道：“今天我大清朝禮部在這裡再一次召開記者吹風會，就是向世界各國表明我大清朝對於發生在朝鮮的這場日俄戰爭的高度關注，就像我在上次吹風會上申明的那樣，就是我大清對於朝鮮的局勢不會坐視不管的，特別日俄雙方有一方敢於在朝鮮展開針對平民的殺戮，我大清朝就會立即出兵給予制止。”
孫志仁在吹風會上兩名的態度幾乎與從前的主張沒有一絲一毫的變化，這對日俄兩國來說都是一個好消息，也讓他們看出可以繼續與大清朝進行談判的希望，於是日俄雙方再次展開了與大清朝的談判高潮，當然日俄雙方給予大清的讓步更加豐厚了。
日本國最後給出的條件就是隻要大清朝在日俄戰爭中保持中立，那就是對日本的幫助，日本國就會將過去槍戰大清的琉球羣島，釣魚島以及黃海東海上的一些島嶼全部歸還大清朝。
於是在孫志仁的禮部衙門，大清朝與日本國就達成的私下協議代表大清朝政府作了簽字畫押之後，日本公使麻生太郎如實重負，看着已經秘密達成的協議，長長的嘆了一口氣之後，便癱坐在禮部大堂上不能動彈了。
因爲這幾天的談判對他來說是異常的艱鉅，老道狡詐的孫志仁在談判之中一點也不退讓，一直堅持大清朝不與日方結盟，不允許日方公開談判結果等等要求，麻生太郎爲了確保日本國在朝鮮目前的平衡狀態，在徵得天皇的許可之後，這才與大清朝簽訂了這份秘密協議。
最後日本公使麻生太郎在公使參贊橫濱鳩山的攙扶之下離開了禮部衙門。
隨後孫志仁由於俄國公使在禮部舉行聊整整一天的談判，最後俄國公使暴跳如雷，指責大清朝是那樣的狡詐，在日俄戰爭坐收漁人之利，甚至用手指着孫志仁說道：“你要小心，將來有機會我會讓你知道我們俄羅斯是多麼的強大。”
孫志仁在俄羅斯公使發泄完之後，拍案而起的說道：“公使先生，請你注意一下你的行爲，你這是在我的禮部衙門進行談判，不是我在俄國去求你談判的，若果你願意接受我方提出的條件，你現在可以離開我這裡，同時我也告訴你，你是我這裡不受歡迎的人，希望你今後不要再在我這裡出現。”
孫志仁說完之後便伸手作了一個手勢，讓俄國公使自行離開這裡。孫志仁這時起身要回內府去，不再理會那俄國公使了。
那粗魯的俄國人被孫志仁那慢條斯理的幾句話一下子給擊中了，神情立馬黯淡下來，一下子坐在椅子上，不在言語了。
那公式參贊意見情況不對，雙方談崩了，趕忙上前將孫志仁給攔住，他躬身朝孫志仁說道：“孫大人，請留步，是我們公使先生無理了，請你諒解，有什麼不到之處和說話魯莽還請大人見諒。”
那公使參贊知道目前只能由他來與孫志仁進行談判，因爲那公使先生的粗魯讓談判幾乎無法進行下去了。
孫志仁對於那俄國公使的態度也是十分的惱怒，這纔要將那俄國公使給轟出去，孫志仁在想目前是你俄羅斯有求於我大清朝，你不答應我的條件，只要我大清稍稍的動一下，你俄羅斯就將承受不了了，那朝鮮的戰局立馬就會發生乾坤大逆轉的。其中的利害關係他想你俄國人不是不知道的吧。
當俄國公使參贊出面相邀請孫志仁留步時，孫志仁看着那公使參贊沙巴羅夫說道：“參贊先生，這時我給你面子，要是依着你們公使先生，我從此不再與貴國進行任何談判了，如今是貴國有求與我大清，不是我們在你們聖彼得堡跪求你們，你看看他既然公開攻擊我個人的人身安危，我倒想想看看他能夠將我怎樣？”
公使參贊沙巴羅夫只好滿臉賠笑認認真真的聽完孫志仁發出不滿的話語，一遍笑着說道：“孫大人，用你們大清朝的一句古語，宰相肚裡能撐船，您就不要計較他了，現在我請你坐下來繼續談判，只要本着兩國友好的關係，什麼問題都快一進行談判。”
孫志仁看着沙巴羅夫說道：“這談判的最後結果你能決定嗎？”
那公使參贊笑着說道：“雖然我不能做決定，但是我可以請示沙皇陛下，請他做決定還不行嗎？”
孫志仁見他他如此說道，便請沙巴羅夫做到另一處桌子上在進行談判，最後雙方達成一致，就大清與俄國對雙方邊界線進行重新勘驗，重新劃分，基本上按照當初康熙皇帝與俄國彼得大帝當初確定的邊界走向而定，同時俄國將近幾十年來侵佔大清的領地全部歸還大清朝，最後並且保證不支持當時已經有鬧獨立苗頭的外蒙古獨立。
最後公使參贊代表俄國在雙方達成的協議上草簽了自己的姓名，然後對孫志仁說道：“孫大人此份協議我還需報送沙皇籤批之後，我再將原本協議送與孫大人好不好？”
孫志仁對於最後與俄羅斯達成的協議相對是滿意的，對於俄國人能夠做如此大的讓步，他是感覺到非常欣慰的，這時他近年連續簽訂兩條最讓國人滿意的協議，當然協議中的內容只有大清朝與俄國最高層知道，協議的內容不對外公示。
在協議談妥之後，孫志仁將俄羅斯公使與公使參贊送出禮部衙門之後，孫志仁在才送了一口氣，他自己站在禮部衙門的院子裡轉了幾圈，在心中說道：“皇上、皇太后臣孫志仁盡力了，不辱使命，隨後孫志仁將與日本以及俄羅斯達成的秘密協議的藍本送到宮裡給皇上上與太后圈閱去了。
慈安最後在孫志仁的秘密協議上用硃筆簽寫了這樣一句話：“孫志仁口舌之爭當比我大清數十萬兵馬，已經將我大清朝的近幾十年所遭受的恥辱給清洗乾淨了，禮部侍郎孫志仁理當受獎，請皇上閱辦。
皇上在看到李蓮英報送給他的大清與俄羅斯、大清與日本就朝鮮問題進行秘密談判所達成的協議之後，更是心情舒暢，在慈安的硃批下面寫着，孫志仁進軍機處，在上書房行走，兼任禮部侍郎，是因爲目前大清朝還找不一個向孫志仁這樣能夠主持禮部的事務的人物來。
兩天之後孫志仁分別收到日本與俄羅斯兩國政府對於大清朝與俄羅斯、大清朝與日本簽署的秘密協議生效的秘密批覆之後，孫志仁又在隨後舉辦的急記者吹風會上表示，鑑於朝鮮目前的情況，大清朝宣佈保持中立，但是大清朝依然保持對朝鮮市局高度關注，防止在朝鮮發生有關爭對平民的屠殺行爲的發生。同時大清朝在延吉扶持並建立了朝鮮流亡政府，大院君擔任首屆流亡政府的的負責人，大清朝將向朝鮮流亡政府提供一切基本保障。